เมื่อองค์กรไอเอ็มเอฟปิดตัวลง สายลับอีธาน ฮันท์และพันธมิตรจึงประกาศสงครามกับ ซินดิเคท กลุ่มสายลับที่ทรยศต่อองค์กรและวางแผนที่จะทำลายล้างโลก